ज्योतिष पीठ एवं द्वारका शारदापीठ के शंकराचार्य स्वामी स्वरूपानंद सरस्वती ने सामाजिक कार्यकर्ता स्वामी अग्निवेश को आतंकवादी कहा है। आर्यसमाजी अग्निवेश ने साईं बाबा विवाद में शंकराचार्य के खिलाफ बयान दिया था। संभवत: इसी की प्रतिक्रिया में शंकराचार्य ने उन्हें 'आतंकवादियों से मिला हुआ'और 'आतंकवादी'बताया है। छत्तीसगढ़ के कवर्धा में बुधवार की शाम पत्रकारों से चर्चा में उन्होंने कहा, "स्वामी अग्निवेश के अब छत्तीसगढ़ आने पर यहां के मुख्यमंत्री भी उससे नहीं मिलते हैं, और उसके विषय में अब जनता की भी स्पष्ट राय बनने लगी है।"
उन्होंने कहा, "अग्निवेश माफी मांगें। शंकराचार्य को उन्होंने दुकानदार कैसे कहा? वह तुच्छ आदमी हैं। फिर भी धर्म संगठन उनका विरोध कर उन्हें प्रसिद्ध न करे।"